Este art铆culo contiene una lista de el mejor conversor gratuito de PDB a PDF software para Windows. Utilizando este software gratuito, puedes convertir la estructura molecular almacenada en un archivo Banco de Datos de Prote铆nas ( PDB ) a Formato de Documento Port谩til ( PDF ). B谩sicamente, puedes guardar la vista de una estructura molecular en un formato imprimible como PDF. Para ello, puede incluso personalizar la vista molecular estableciendo varios par谩metros de visualizaci贸n, como estilo de vista (Wireframe, Backbone, Sticks, Spacefill, Balls & Stick, Ribbons, etc.), esquema de colores, mostrar u ocultar etiquetas, vista molecular (谩tomos, hidr贸geno, etc.), etc. Tambi茅n puede rotar o hacer zoom en la estructura molecular y luego convertir la vista en formato PDF.
Muchos de estos programas listados son programas de modelado molecular. Por lo tanto, se puede modificar la estructura utilizando las herramientas de construcci贸n de mol茅culas disponibles como a帽adir 谩tomos, a帽adir hidr贸geno, a帽adir estructuras qu铆micas , etc. Adem谩s, estos son bastante buenos en la visualizaci贸n de mol茅culas ya que proporcionan un buen conjunto de herramientas de visualizaci贸n como rotar, hacer zoom, modo de visualizaci贸n, mostrar etiquetas, mover, girar, etc. Adem谩s, muchas de ellas tambi茅n muestran estad铆sticas relacionadas con el modelo molecular y proporcionan herramientas de c谩lculo y an谩lisis.
Adem谩s de PDB, tambi茅n puedes convertir otros archivos moleculares a PDF en la mayor铆a de estos programas. Los formatos de entrada m谩s com煤nmente soportados incluyen MOL, MOL2, ENT, XYZ, y CML. En cuanto a la salida, puede convertir PDB a varios formatos de imagen como PNG, BMP, JPG, PS, EPS, etc. Revise el art铆culo para saber m谩s sobre estos programas.
Contenidos
Mi software gratuito favorito de conversi贸n de PDB a PDF para Windows:
Avogadro es mi software convertidor de PDB a PDF favorito en esta lista, ya que es un software avanzado que tambi茅n es bueno para la visualizaci贸n y el modelado de mol茅culas. Tambi茅n est谩 muy bien dise帽ado con algunas herramientas adicionales relacionadas con el modelado molecular.
Molekel es otra buena que puedes intentar convertir PDB a PDF.
Tambi茅n puede que le gusten algunos de los mejores programas gratuitos de PDB Viewer, de modelado molecular y de simulaci贸n qu铆mica para Windows.
Avogadro
Avogadro es uno de los programas de modelado molecular de c贸digo abierto m谩s populares para Windows, Linux y Mac. Tambi茅n puede ser usado para convertir PDB a PDF ya que provee una caracter铆stica dedicada para ello. Tambi茅n se puede usar para convertir PDB a otros formatos como PNG, BMP, JPG, SVG, EPS, POV, VRML, etc.
Generalmente, este software se utiliza para la visualizaci贸n, construcci贸n y edici贸n de mol茅culas. Para ello, contiene un conjunto de herramientas con muchas caracter铆sticas que pueden ser utilizadas. Algunas de sus herramientas incluyen Perspectiva o Proyecci贸n ortogonal , Modo de pantalla completa, Agregar hidr贸genos, Insertar (Fragmento, DNARNA, SMILES, y P茅ptido), Constructor de Super C茅lulas, Constructor de Nanotubos, Cambiar H a Metilo, Editor Cartesiano, etc.
C贸mo convertir PDB a PDF en Avogadro:
- Usando su funci贸n de apertura, importa un archivo PDB a este software.
- Editar el modelo molecular con las herramientas disponibles, si es necesario.
- Ahora, vaya a su men煤 Archivo y haga clic en la opci贸n Exportar> Gr谩ficos vectoriales y seleccione PDF como formato de salida para guardar la vista molecular en formato PDF.
Antes de la conversi贸n de PDB a PDF, puede personalizar la configuraci贸n de la pantalla para exportar una vista personalizada de las mol茅culas a un archivo PDF o gr谩fico. Estos ajustes de visualizaci贸n incluyen mostrar ejes ocultos, fuerza, dipolo, pol铆gono, anillo, palo, superficies, marco de alambre, etc.
Caracter铆sticas adicionales:
- Contiene varias extensiones que mejoran a煤n m谩s su funcionalidad, como Optimizar la geometr铆a, Calcular la energ铆a, B煤squeda de conformadores, Sombreadores GLSL, etc.
- Adem谩s de PDB, soporta varios formatos de archivos de entrada como CML, XYZ, MOL, MOL2, ENT, GAMOUT, etc.
Conclusi贸n:
Es un gran software convertidor de PDB a PDF de c贸digo abierto y gratuito que proporciona una salida de buena calidad. Tambi茅n puede modificar el archivo PDB antes de iniciar la conversi贸n a PDF o a cualquier formato gr谩fico.
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Molekel
Molekel es un software gratuito de visualizaci贸n de archivos de mol茅culas que tambi茅n se puede utilizar para convertir PDB a PDF. Proporciona una opci贸n directa para convertir archivos PDB al formato PDF. De esta manera, puedes importar f谩cilmente un archivo de estructura PDB y luego guardarlo en un archivo PDF. Adem谩s, puede convertir otros archivos moleculares a PDF, ya que soporta un amplio n煤mero de formatos de entrada, incluyendo XYZ, YOB, ALC, SDF, SMI, RXN, PCM, PQS, MOL, MOL2, TMOL, etc.
C贸mo convertir PDB a PDF en Molekel:
- Simplemente abre un archivo PDB en 茅l, que puedes ver y analizar adecuadamente usando sus herramientas de visualizaci贸n avanzadas.
- Ahora, en su men煤 Archivo, haga clic en la opci贸n Guardar en PDF para convertir PDB en PDF.
Caracter铆sticas adicionales:
- Puede personalizar varios ajustes de visualizaci贸n antes de convertir la estructura del PDB a PDF, como el fondo, la vista de las mol茅culas (ball & stick, stick, wireframe, etc.), el 谩tomo, la uni贸n, las propiedades de la vista 3D, etc.
- Te permite grabar la animaci贸n molecular y exportarla.
- Proporciona algunas caracter铆sticas de an谩lisis incluyendo sonda plana, distancia, 谩ngulo, 谩ngulo diedro y espectro de radiaci贸n.
- Puede convertir los archivos PDB y otros archivos de estructuras moleculares en im谩genes PS, EPS, PNG y TIFF.
- Tambi茅n puede ver las propiedades b谩sicas del modelo molecular y las estad铆sticas relacionadas con 谩tomos, enlaces, energ铆a, residuos, conformadores, masa molar, masa exacta, multiplicidad de esp铆n, frecuencias de vibraci贸n, etc.
Conclusi贸n:
Es un buen conversor de PDB a PDF que tambi茅n proporciona algunas herramientas avanzadas de visualizaci贸n molecular.
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RasMol
RasMol es otro software gratuito de conversi贸n de PDB a PDF para Windows. Es un bonito visor de archivos moleculares que tambi茅n puedes usar para convertir PDB u otro archivo de entrada soportado a varios otros formatos. Estos formatos incluyen BMP, GIF, IRIS RGB, PPM, Sun Raster, PostScript, POVRay, VRML, Raster3D , etc. Sin embargo, para convertir PDB a PDF, tendr谩s que usar su funci贸n de impresi贸n. Veamos los pasos ordenados que hay que realizar para convertir una estructura molecular guardada en un archivo PDB a PDF.
C贸mo convertir PDB a PDF en RasMol:
- Importar un archivo PDB en 茅l usando la opci贸n Abrir.
- Despu茅s de eso, puede configurar la visualizaci贸n de la estructura molecular utilizando las opciones disponibles como el modo de visualizaci贸n (wireframe, backbone, sticks, ball & sticks, ribbons, strands, etc.), colores (monocromo, cadena, temperatura, habilitar o deshabilitar opciones como los modos de losa, hidr贸genos, hetero谩tomos, etiquetas, est茅reo, etc., y m谩s.
- Ahora puede utilizar su funci贸n de impresi贸n para convertir la vista personalizada de la estructura molecular del PDB al formato PDF.
Conclusi贸n:
Es otro buen software convertidor de PDB a PDF, ya que tambi茅n puede convertir PDB a varios otros formatos gr谩ficos como se ha mencionado anteriormente. Adem谩s, soporta muchos otros formatos de archivo como entrada aparte de PDB, como Alchemy File Format, Sybyl MOL2 Format, MDL Mol File Format, CIF File Format, MOPAC File Format , etc.
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ArgusLab
ArgusLab es un software gratuito de construcci贸n molecular que puede utilizarse para convertir PDB a PDF. Us谩ndolo, puede importar y ver f谩cilmente archivos de datos moleculares como PDB, XYZ, MOL, MOL2, etc., as铆 como convertir estos archivos a otros formatos incluyendo PDF, TIFF, BMP, JPG, y POV. Como le permite construir modelos moleculares, tambi茅n puede editar un archivo PDB antes de la conversi贸n.
C贸mo convertir PDB a PDF usando ArgusLab:
- Al principio, abre un archivo PDB en 茅l que podr谩s ver en su interfaz.
- Ahora, si es necesario, se puede modificar el modelo molecular utilizando herramientas como modo de traducci贸n, a帽adir 谩tomos, a帽adir hidr贸genos, eliminar hidr贸geno, crear y editar superficies, etc.
- A continuaci贸n, para guardar la vista del modelo PDB en formato PDF, haga clic en su men煤 Archivo> opci贸n Imprimir y seleccione 芦Microsoft Print to PDF禄 como la impresora. De esta manera, podr谩 convertir el PDF a PDF.
Caracter铆sticas adicionales:
- Permite explorar diferentes elementos de un PDB o cualquier otro archivo molecular como 谩tomos, residuos, grupos, etc.
- Permite realizar diversos c谩lculos relacionados con el modelo molecular como la energ铆a, optimizar la geometr铆a, Gaussiano, etc.
Conclusi贸n:
Es un destacado software de construcci贸n de mol茅culas que tambi茅n act煤a como convertidor de PDB a PDF.
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Jmol
Jmol es otro software convertidor de PDB a PDF de c贸digo abierto y gratuito para Windows. Es un bonito software modelador de mol茅culas con el que puedes ver, editar y construir archivos moleculares. Adem谩s de PDB, funciona con algunos otros formatos como MOL, MOL2, XYZ, CML, ENT, y muchos m谩s formatos de archivos de mol茅culas inusuales.
C贸mo convertir PDB a PDF usando este modelador molecular gratuito de c贸digo abierto:
- En primer lugar, vaya al men煤 Archivo y utilice la opci贸n Abrir para importar un archivo PDB en 茅l.
- Ahora, puedes editar la estructura molecular usando las herramientas de modelado disponibles.
- Despu茅s de eso, usa su funci贸n de impresi贸n para convertir el PDB al formato PDF. Mientras lo hace, aseg煤rese de haber configurado la impresora a Microsoft Print a PDF .
Caracter铆sticas adicionales:
- Contiene algunas herramientas adicionales que puede utilizar seg煤n sus necesidades como Animar, Medir, Vibrar, Herramienta de Superficie, Crear Archivo de Entrada Gaussiano, etc.
Conclusi贸n:
Es un bonito convertidor port谩til de PDB a PDF que no requiere instalaci贸n. Puedes usarlo directamente sobre la marcha desde cualquier dispositivo de almacenamiento port谩til.
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BALLView
BALLView es otro software convertidor gratuito de c贸digo abierto de PDB a PDF de esta lista. Como otros programas de la lista, tambi茅n permite importar un archivo PDB y luego imprimir la vista de la estructura molecular en formato PDF. Adem谩s de PDF, tambi茅n puedes usarlo para convertir PDB a otros formatos incluyendo PNG, POV, XHTML, VRML, y STL.
Adem谩s de PDB, soporta algunos otros formatos de archivos qu铆micos que puedes ver, editar o convertir. Estos formatos de entrada incluyen MOL, MOL2, XYZ, ENT, AC, SD, etc.
C贸mo convertir PDB a PDF usando BALLView:
- El primer paso es importar un archivo PDB usando su opci贸n Archivo> Abrir> Estructura.
- A continuaci贸n, utilice su opci贸n de impresi贸n y seleccione Microsoft Print to PDF como impresora para convertir PDB en PDF.
Conclusi贸n:
Es otra alternativa decente para convertir un archivo de Banco de Datos de Prote铆nas a formato PDF.
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